まとめてリンク文字や メニューバー、ページャー、続きを読む、サイドバーの色を変更するコードを書きました。
デザインCSSに追加でコピペして下さい。
他の色にもコードを参考に変更してみてください。
追記:セレクタごとに分けました。必要なところをお使いください。指定が適応されない場合はプロパティに!importantを付け加えて下さい。

アクセントカラー黒系#454545、#303030リンクの色はてなデフォルト#1487bd,#0f5373にする場合のCSSコード(上記スクリーンショットのような感じになります。
/* リンク文字の色*/
a {
color: #1487bd;
}
a:hover {
color: #0f5373;
}
a:visited {
color: #789dae;
}
.entry-content h3 {
color:#303030;/* 大見出しの文字の色 */
}
.entry-content h3 {
border-left: 3px solid #303030;/*左横バーの色*/
}
.entry-content h4 {
border-bottom: 2px solid #454545;
}
.entry-content h4::before {
background: #454545;
}
.entry-content h4::after {
background: #ccc;
}
/* サイドバーモジュールタイトル */
.hatena-module-title {
color: #454545;/* サイドバータイトルの色 */
}
.hatena-module-title a {
color: #454545;
text-decoration: none;
}
/* urllist module
リンク・最新記事・最近のコメント・月別アーカイブ・カテゴリモジュールは .hatena-urllist という共通の class が振られます
*/
.hatena-urllist li a {
color: #1487bd;
}
.hatena-urllist li a:hover {
text-decoration: underline;
color: #0f5373;
}
.entry-header .date{
border:3px solid #303030;/* 日付を囲む○の枠の色 */
background:#fff;/* 背景色 */
color:#303030!important;/* 日付の文字の色 */
}
.entry-header .date a{
color:#303030!important;/* 日付の文字の色 */
}
.archive-entry .date a{
color:#454545!important;/* アーカイブページの日付の文字の色 */
}
.entry-see-more {
background-color: #454545!important;/* 背景色 */
color: #fff!important;/* 続きを読むの色 */
}
.entry-see-more:hover {
background-color:#454545!important;/* ホバーした時の背景色 */
opacity: 0.5;/* ホバーした時の半透明にする */
}
/* カテゴリー */
.categories a {
border: 1px solid #454545;/* カテゴリーを囲む枠の色 */
color:#454545!important;/* カテゴリー文字の色 */
}
.categories a:hover {
color: #333!important;/* カテゴリー文字の色 */
background-color: #fff;/* カテゴリー枠の背景色 */
}
.categories a:visited {
color: #333!important;/*カテゴリー文字の色*/
}
.page-archive .categories a {
color: #fff;/* アーカイブページのカテゴリーの色 */
background: #454545!important;/* アーカイブページのカテゴリーの背景色 */
}
/* Pager */
.pager a{
color:#333; /* 次への文字の色 */
}
.pager-next a:before,.pager-prev a:before{
background-color:#454545;/* 円の背景色 */
color:#fff;/* 中の矢印マークの色 */
}
/* ページ上部へ戻る */
.pagetop a{
background-color:#303030!important;
}
.pagetop a:hover{
background-color:#303030!important;
opacity:0.5;
}
/* グローバルメニューCSS */
#menu{
width: 100%;
margin: 0 auto;
background: #303030;/*7*/
}
#menu-inner{
width: 100%;
height: 40px;/*2*/
margin: 0 auto;
background: #303030;/*8*/
}
#menu-content > li > a{
background: #303030;/*9*/
color: #fff;/*10*/
}
#menu-content > li > a:hover{
background: #303030;/*11*/
color: #fff;/*12*/
}
/* 2階層目 */
#menu-content > li > ul.second-content > li > a{
background: #303030;/*13*/
color: #fff;/*14*/
}
#menu-content > li > ul.second-content > li > a:hover{
background: #303030;/*15*/
color: #fff;/*16*/
}
/******* トグルメニュ *********/
@media screen and (max-width:960px){/*19*/
#menu-btn{
background: #303030;/*17*/
color: #fff;/*18*/}
}
/* グローバルメニューCSSここまで */











